Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Dsg1bQ7TSF1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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