Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms