Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms