Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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