Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms