Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn1Q64347 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn1Q64347 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn1Q64347 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms