Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms