Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sox19Q62249 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sox19Q62249 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sox19Q62249 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sox19Q62249 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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