Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Foxj1Q61660 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Foxj1Q61660 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Foxj1Q61660 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Foxj1Q61660 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Foxj1Q61660 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Foxj1Q61660 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Foxj1Q61660 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Foxj1Q61660 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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