Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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