Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms