Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms