Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx49Q4FZF3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms