Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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