Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms