Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms