Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms