Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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