Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms