Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms