Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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