Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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