Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms