Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms