Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samd12Q0VE29 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samd12Q0VE29 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms