Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms