Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms