Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms