Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms