Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms