Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms