Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

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Length 988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nbr1P97432 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nbr1P97432 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nbr1P97432 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nbr1P97432 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nbr1P97432 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nbr1P97432 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nbr1P97432 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Nbr1P97432 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nbr1P97432 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nbr1P97432 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nbr1P97432 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nbr1P97432 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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