Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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