Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx3P70354 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Msx3P70354 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Msx3P70354 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Msx3P70354 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Msx3P70354 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx3P70354 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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