Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms