Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms