Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms