Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Irf5P56477 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Irf5P56477 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Irf5P56477 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Irf5P56477 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Irf5P56477 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Irf5P56477 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Irf5P56477 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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