Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms