Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp10P52479 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp10P52479 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp10P52479 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms