Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TspoP50637 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TspoP50637 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms