Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpdP50404 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpdP50404 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms