Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hoxc13P50207 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hoxc13P50207 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hoxc13P50207 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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