Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ccl11P48298 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ccl11P48298 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccl11P48298 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccl11P48298 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms