Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd4P46935 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd4P46935 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd4P46935 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd4P46935 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd4P46935 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd4P46935 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd4P46935 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd4P46935 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4P46935 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4P46935 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4P46935 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4P46935 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4P46935 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4P46935 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4P46935 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms