Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms