Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms