Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tjp1P39447 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms