Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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