Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Hoxd10P28359 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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